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Quelles annotations fonctionnelles pourraient être utiles ?


Analyser un génome, pour un gène générique, quelles annotations fonctionnelles (par exemple de Gene Ontology) peuvent aider à comprendre sa signification/fonction ou, au moins, fournir des informations utiles ?

  • Annotations de ce gène
  • Annotations de gènes orthologues (?)
  • Annotations de gènes paralogues (?)
  • Gènes co-exprimés (compte tenu d'une condition biologique) (?)
  • Quoi d'autre?

Merci.


  • J'ajouterais les effets génétiques du gène et de ses orthologues chez ce propre hôte. Les knock-out et la surexpression sont puissants pour découvrir la fonction.
  • En termes d'expression de base ou normale, j'ajouterais des points de temps de tissu, de développement ou de différenciation et des conditions qui stimulent ou répriment l'expression.