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18 : Diversité des plantes - Biologie


18 : Diversité des plantes

Guêpes : leur biologie, leur diversité et leur rôle en tant qu'insectes bénéfiques et pollinisateurs de plantes indigènes Relié – 15 février 2021

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Fond

Les plantes produisent une grande variété de métabolites secondaires (MS) qui sont impliqués dans l'adaptation des plantes aux stress biotiques et abiotiques [1,2,3]. À l'heure actuelle, plus de 200 000 MS ont été isolés et identifiés, y compris différentes classes chimiques telles que les glucosinolates, les alcaloïdes, les terpènes et les flavonoïdes. Typiquement, les espèces au sein d'un clade partagent des classes similaires de SM [2]. Par exemple, les glucosinolates sont des SM majeurs presque universellement chez les Brassicaceae, les Capparidaeae et les Caricaceae [4], et les alcaloïdes benzylisoquinoléines sont principalement présents chez les Papaveraceae, les Ranunculaceae, les Berberidaceae et les Menispermaceae [5], tandis que les alcaloïdes pyrrolizidiniques (AP) se répartissent de préférence dans les familles des Astéracées, des Boraginacées, des Fabacées et des Orchidacées [6]. Chaque classe de SM contient un certain nombre de molécules similaires dérivées du même squelette différant principalement par des groupes de substitution par addition d'un certain nombre de substituants polaires et non polaires. Cette diversité structurelle est bien documentée pour les AP en Jacobée espèce de la famille des Astéracées. Trente-sept AP structurellement apparentés ont été détectés dans Jacobaea vulgaris Gaertn., Jacobaea aquatica (Colline) G.Gaertn., B.Mey. & Scherb et leurs hybrides [7]. Pour l'instant, on ne comprend pas complètement comment la diversité des métabolites secondaires se produit et pourquoi elle est maintenue dans la nature.

Pour comprendre l'origine de la diversité SM, les études moléculaires des voies de biosynthèse SM sont prometteuses car on pense que la diversité SM des plantes est sous contrôle génétique [8,9,10,11]. Les gènes impliqués dans la biosynthèse du SM ont souvent évolué à partir de gènes impliqués dans le métabolisme primaire par duplication de gènes avec diversification successive [4, 12]. Beaucoup de ces gènes impliqués dans les voies SM appartiennent à de grandes familles de gènes [3], comme le cytochrome P450 [13, 14]. Les gènes de la monooxygénase du cytochrome P450 (CYP) forment une grande famille dans une espèce végétale donnée et jouent un rôle important dans le métabolisme secondaire [15]. De nombreux CYP sont impliqués dans la biosynthèse de divers SM car ils catalysent les modifications oxydatives de divers substrats en utilisant l'oxygène et le NAD(P)H. Structurellement, tous les CYP végétaux trouvés jusqu'à présent sont des enzymes liées à la membrane et sont principalement ancrés dans la membrane du réticulum endoplasmique via une séquence signal hydrophobe à l'extrémité N-terminale [16, 17]. Les protéines CYP partagent des motifs bien conservés, notamment la signature de liaison à l'hème, le motif PERF, l'hélice K et l'hélice I, qui sont essentiels à l'activité catalytique [18]. Le fait que les CYP soient souvent recrutés comme catalyseurs polyvalents dans la biosynthèse des SM fait de ces enzymes des points de repère dans l'évolution de la diversité chimique spécifique aux espèces [19].

Un ensemble bien organisé de gènes CYP d'une espèce particulière est essentiel pour l'identification fonctionnelle des enzymes codées. Ces dernières années, l'identification à l'échelle du génome/transcriptome des CYP des plantes a été réalisée pour explorer leur implication dans les voies métaboliques [20,21,22,23,24]. Par exemple, Liao et al. [23] ont identifié 118 gènes CYP complets et 175 partiels dans Taxus chinensis (Rehder & E.H.Wilson) Transcriptomes de Rehder dans le but de découvrir des gènes candidats impliqués dans la biosynthèse des diterpénoïdes dont le taxol. Chen et al. [24] ont trouvé 116 gènes CYP complets et 135 gènes partiels dans Salvia miltiorrhiza Transcriptomes Bunge avec des candidats pour la biosynthèse des terpénoïdes.

Les AP ont été sélectionnées pour lancer la découverte de gènes structuraux causant la diversité SM dans notre étude. Jusqu'à présent, la seule enzyme spécifique de la voie de biosynthèse de l'AP qui a été identifiée est l'homospermidine synthase, qui convertit la spermidine et la putrescine en homospermidine, le premier intermédiaire spécifique de la voie de biosynthèse de l'AP [25]. On ne sait pas comment l'homospermidine est convertie en sénécionine, structure de l'épine dorsale centrale de PA. N-oxyde. Sénécionine N-oxyde subit des transformations structurelles d'une manière spécifique à la position et stéréosélective entraînant le réarrangement de la structure squelettique et des modifications oxydatives de celle-ci [9]. Il a été montré que la diversification des AP en Jacobée l'espèce est présente dans les pousses tandis que la sénécionine primaire de PA N-oxyde est synthétisé dans les racines [26, 27]. A l'exception de la sénécivernine, il a été déduit que la diversification des AP à partir de la sénécionine N-oxyde à d'autres PA est provoqué par des réactions spécifiques en une ou deux étapes comprenant l'époxydation, l'hydroxylation, la déshydrogénation et/ou O-acétylation [9, 28]. Les enzymes responsables de ces processus n'ont pas été identifiées. Les candidats aux réactions oxydatives sont membres de la famille CYP. Une étude complète et une comparaison des CAP entre différents Jacobée espèces seront bénéfiques pour identifier des candidats CYP potentiels impliqués dans la biosynthèse des AP.

Nous avons établi des assemblages de transcriptome de novo pour J. vulgaris et J. aquatica et mis en place des informations complètes sur les familles CAP. Ces deux espèces étroitement apparentées ont été bien étudiées pour leurs contrastes PA [7, 29], mais des informations génomiques ou transcriptomiques limitées sont disponibles. Nous avons d'abord identifié des CYP putatifs de pleine longueur classés en différentes familles de CYP et extrait les motifs conservés. De plus, nous avons étudié l'implication potentielle de ces CYP dans diverses voies métaboliques sur la base de la base de données KEGG. Nous avons ensuite effectué des analyses phylogénétiques des plus grandes familles de CYP dans Jacobée espèces et deux autres espèces des Astéracées utilisant les CYP de Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. en tant qu'exogroupe pour explorer la parenté et l'évolution des CAP à travers cinq espèces.


Les expansines végétales : diversité et interactions avec les parois cellulaires végétales

La distinction entre les expansines et les protéines de type expansine est clarifiée.

La mutagenèse dirigée révèle la liaison du complexe expansine aux parois cellulaires végétales.

L'action de l'expansine provient de sa liaison à des sites sélectifs sur les microfibrilles de cellulose.

L'expression ectopique de l'expansine améliore la tolérance au stress hydrique.

Les expansines ont été découvertes il y a deux décennies en tant que protéines de la paroi cellulaire qui interviennent dans la croissance induite par l'acide en catalysant le relâchement des parois cellulaires végétales sans lyse des polymères de la paroi. Dans l'intervalle, notre compréhension des expansines est devenue plus complexe grâce à l'analyse bioinformatique de la distribution et de l'évolution des expansines, ainsi qu'à l'analyse de l'expression, à la dissection des facteurs de transcription en amont régulant l'expression et à l'identification de classes supplémentaires d'expansine par séquence et similarités structurelles. Les analyses moléculaires des expansines des bactéries ont identifié des résidus essentiels à l'activité de relâchement des parois et clarifié la nature bifonctionnelle de la liaison de l'expansine aux parois cellulaires complexes. La modulation transgénique de l'expression de l'expansine modifie la croissance et la physiologie du stress des plantes, mais pas toujours de manière prévisible ou même compréhensible.


DISSECTER UNE FLEUR

Le diagramme floral est toujours dessiné de forme circulaire. Les différents verticilles floraux sont représentés en cercles concentriques, les sépales sur le cercle le plus externe, puis les pétales, les étamines et les carpelles vers l'intérieur. La première étape pour dessiner un diagramme floral consiste à examiner les boutons floraux matures qui doivent s'ouvrir sous peu mais ne se sont pas encore ouverts. …


Effets de l'utilisation des terres et du changement climatique sur la taille de la population et le risque d'extinction des plantes andines

On prévoit que les espèces végétales andines modifieront leur répartition, ou « migreront », vers le haut en réponse au réchauffement futur. Les impacts de ces changements sur la taille des populations d'espèces et leurs capacités à persister face au changement climatique dépendront de nombreux facteurs, notamment la répartition des individus dans les aires de répartition des espèces, la capacité des espèces à migrer et à rester en équilibre avec le climat, et modes d'utilisation des terres par l'homme. L'utilisation des terres par l'homme peut être particulièrement importante dans les Andes, où les activités anthropiques au-dessus de la limite des arbres peuvent créer une barrière solide aux migrations ascendantes, mettant en péril la biodiversité andine de haute altitude. Afin de mieux comprendre comment le changement climatique peut avoir un impact sur le hotspot de la biodiversité andine, nous prédisons les réponses distributionnelles de centaines d'espèces végétales aux changements de température en intégrant les distributions de densité de population, les taux de migration et les modèles d'utilisation des terres par l'homme. Nous montrons que les espèces végétales des hautes forêts andines peuvent augmenter la taille de leurs populations si elles sont capables de migrer vers les vastes zones terrestres situées au-dessus de la limite forestière actuelle. Cependant, si le rythme du changement climatique dépasse les capacités des espèces à migrer, toutes les espèces subiront d'importantes pertes de population et pourraient par conséquent faire face à un risque élevé d'extinction. En utilisant des taux de migration intermédiaires cohérents avec ceux observés pour la région, la plupart des espèces devraient encore connaître des déclins de population. Dans un scénario d'utilisation des terres du statu quo, nous constatons que toutes les espèces connaîtront des pertes de population importantes, quel que soit le taux de migration. L'effet de l'utilisation humaine des terres est plus prononcé pour les espèces de haute altitude qui passent des augmentations prévues de la taille des populations à des diminutions prévues. L'influence primordiale de l'utilisation des terres sur les réponses prévues des espèces andines au changement climatique peut être considérée comme encourageante car il est encore temps de lancer des programmes de conservation qui limitent les perturbations et/ou facilitent la migration ascendante et la persistance des espèces végétales andines.

Tableau S1. Liste de tous les herbiers et collections contribuant aux enregistrements de collections de plantes utilisés dans cette étude, accessibles via le Global Biodiversity Information Facility (12/2008-1/2009).

Tableau S2. Changements dans la taille de la population végétale andine prévus sous un réchauffement incrémentiel de 1 degré de +1° à +8°C intégrant différents scénarios de migration et de changement d'utilisation des terres. Les valeurs positives (en gras) indiquent les augmentations de population prévues.

Tableau S3. Changements de la taille de la population prévus pour les différentes espèces d'arbres andins en raison d'un réchauffement de 5 °C.

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Facteurs affectant la diversité génétique

Événement d'extinction

Tout événement ou processus progressif qui aboutit à l'extinction d'une espèce entraîne la perte de toute la diversité génétique représentée par cette espèce de plante ou d'animal. Des espèces entières peuvent être anéanties en raison d'événements d'extinction de masse comme l'ère glaciaire ou les éruptions de météores et volcaniques qui ont anéanti les dinosaures. Des espèces peuvent également disparaître individuellement en raison de leur chasse excessive en tant que source de nourriture ou de produit de valeur. Par exemple, les oiseaux dodo étaient chassés comme source de nourriture pratique car ils étaient incapables de se livrer à des tactiques d'évasion. De plus, le rhinocéros a été conduit au bord de l'extinction en le chassant pour ses cornes. Alternativement, les espèces peuvent connaître l'extinction en raison d'altérations de leur écosystème. Un exemple serait la déforestation afin d'utiliser la terre pour installer des villes ou des usines. Cela conduirait à la destruction de cet écosystème et de tous les spécimens indigènes qui s'y trouvent. Dans certains cas, certains gènes peuvent également disparaître dans un organisme en raison de son incapacité à être transférés à la génération suivante.

Concurrence

Comme mentionné précédemment, la compétition pour les ressources alimentaires peut entraîner l'adaptation et l'évolution d'une espèce. Cependant, c'est l'effet positif. Si l'effet négatif est pris en compte, il y a de fortes chances que les espèces concurrentes nouvellement arrivées soient plus fortes et mieux adaptées que les espèces indigènes. Cela conduirait les nouvelles espèces à concurrencer les anciennes espèces et à les éloigner de la source de nourriture. L'indisponibilité d'une source de nourriture entraînerait la disparition de l'ancienne espèce et, par conséquent, son extinction. Cependant, ce résultat peut être évité par la migration de l'ancienne espèce vers un nouvel environnement dépourvu d'espèce concurrente.

Événement de goulot d'étranglement

Ces événements font référence à des situations où une quantité considérable de la population meurt en raison de phénomènes naturels ou d'activités humaines. La population survivante ne représente qu'une fraction de la diversité génétique d'origine de l'espèce et, par conséquent, si la population de l'espèce se reconstruit, la diversité génétique globale sera également faible. La diversité perdue nécessitera un temps considérable pour être récupérée. Ceci est associé aux effets secondaires de la consanguinité et de l'homogénéité génétique, conduisant à un effet appelé effet de goulot d'étranglement.


Stress dû aux inondations : acclimatations et diversité génétique

Les inondations sont un stress environnemental pour de nombreux écosystèmes naturels et artificiels dans le monde. La diversité génétique dans la réponse des plantes aux inondations comprend des altérations de l'architecture, du métabolisme et de la croissance de l'élongation associées à une stratégie d'échappement à faible O (2) et à un schéma de quiescence antithétique qui permet l'endurance d'une submersion prolongée. Les inondations s'accompagnent fréquemment d'une réduction du contenu cellulaire en O(2) qui est particulièrement sévère lorsque la photosynthèse est limitée ou absente. Cela nécessite la production d'ATP et la régénération de NAD(+) par respiration anaérobie. L'examen de la régulation et de la fonction des gènes dans les systèmes modèles donne un aperçu des mécanismes de détection de faible O(2) et des ajustements métaboliques associés à l'utilisation contrôlée des glucides et de l'ATP. Au niveau du développement, les plantes peuvent échapper au stress à faible teneur en O(2) causé par les inondations grâce à des altérations à multiples facettes de la structure cellulaire et organique qui favorisent l'accès et la diffusion de l'O(2). Ces processus sont entraînés par des phytohormones, notamment l'éthylène, la gibbérelline et l'acide abscissique. Cette exploration de la variation naturelle des stratégies qui améliorent le statut en O(2) et en glucides pendant les inondations fournit des ressources précieuses pour l'amélioration de l'endurance des cultures face à une adversité environnementale renforcée par le réchauffement climatique.


UW TACOMA DIVISION DES SCIENCES ET DES MATHÉMATIQUES BIOLOGIE - TACOMA

T BIOL 102 Maladies infectieuses au 21e siècle (5) NW
Présente les concepts de base des maladies infectieuses chez l'homme et l'interaction de la biologie et de la société à travers des conférences, des études de cas, des exemples contemporains et de la littérature biomédicale.
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T BIOL 110 Biologie Générale (6) NW
Fournit un aperçu complet de la science biologique, y compris la biologie cellulaire et moléculaire, la génétique et l'évolution, la diversité de la vie et l'écologie. Couvre la complexité de la vie, des molécules aux écosystèmes, avec une combinaison de cours magistraux et d'exercices pratiques en laboratoire. Destiné aux majors non scientifiques et aux majors d'études environnementales. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 110.
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T BIOL 119 Séminaire d'apprentissage collaboratif en biologie (1, max. 3)
Améliore les compétences de résolution de problèmes pour la biologie en faisant travailler les étudiants avec un animateur pour renforcer leurs compétences en pensée critique via des séances de problèmes de groupe en biologie et ses applications. Co-requis : soit T BIOL 120, T BIOL 130 ou T BIOL 140. Crédit/sans crédit uniquement.
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T BIOL 120 Introduction Biologie I (6) NW
Couvre l'écologie et l'évolution, y compris la génétique, l'hérédité mendélienne, la biodiversité des formes de vie et la biologie de la conservation, ainsi que les processus chimiques connexes dans l'environnement. Voyages sur le terrain et laboratoires requis. Premier d'une série de cours d'introduction à la biologie pour les étudiants en sciences. Ne peut être crédité si crédit reçu pour TESC 120. Recommandé : corequis : T BIOL 119
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T BIOL 130 Introduction Biologie II (6) NW
Couvre la biologie moléculaire et cellulaire, y compris la chimie de la vie, le métabolisme et l'énergétique, la structure et la fonction cellulaires, et l'application des techniques moléculaires aux études environnementales. Voyages sur le terrain et laboratoires requis. Deuxième d'une série de cours d'introduction à la biologie pour les étudiants en sciences. Ne peut pas être pris pour crédit si crédit reçu pour TESC 130. Prérequis: une note minimale de 2,0 en TESC 120 ou T BIOL 120 et une note minimale de 2,0 en TESC 141 ou T CHEM 142.
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T BIOL 140 Introduction à la biologie III (6) NW
Se concentre sur la biologie des organismes, y compris l'anatomie, la physiologie et le développement des plantes et des animaux, en conjonction avec les processus chimiques applicables. Troisième d'une série de cours d'introduction à la biologie pour les étudiants en sciences. Comprend le laboratoire requis. Ne peut pas être pris pour crédit si crédit reçu pour TESC 140. Prérequis: une note minimale de 2,0 en TESC 130 ou T BIOL 130 et une note minimale de 2,0 en TESC 151 ou T CHEM 152.
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T BIOL 202 Biologie et écologie végétales (5) NW
Explore la biologie des plantes de l'individu au niveau de l'écosystème. Les sujets comprennent l'anatomie des plantes, la physiologie, la reproduction, le développement et l'adaptation, la dynamique des populations et des communautés végétales, et les réponses des plantes au changement climatique. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 202.
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T BIOL 203 Histoire et écologie des invasions biologiques (5) NW
Explore la dynamique des populations et les impacts écologiques des espèces non indigènes, leur prévention et leur contrôle, et les façons dont les espèces exotiques menacent la biodiversité et les économies régionales et mondiales. Examine les progrès rapides de la science de la biologie des invasions dans ses contextes historiques et de politique publique. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 402.
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T BIOL 204 Écologie tropicale et durabilité (5) NW
Explore les aspects biologiques et culturels des écosystèmes tropicaux. Intègre des concepts de la science de l'environnement, de l'écologie et de l'évolution afin d'acquérir une compréhension de l'écologie tropicale. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 304.
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T BIOL 222 Evolution et ses implications (5) NW
Présente les preuves biologiques et géologiques de l'évolution et de l'histoire de la vie sur Terre. Évalue les implications des processus évolutifs et de l'histoire pour les problèmes actuels de santé, de comportement et d'environnement. Ne peut pas être crédité si le crédit a été obtenu en T BIOL 422.
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T BIOL 232 Problèmes de conservation biologique (5) NW
Tient compte des problèmes biologiques et sociaux sous-jacents aux problèmes environnementaux contemporains. Aperçu de la discipline naissante de la biologie de la conservation. Étudie des cas du nord-ouest du Pacifique (p. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 232.
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T BIOL 234 Biologie, histoire et politique du saumon dans le nord-ouest du Pacifique (5) NW
Explore des questions telles que la biologie du saumon, la dégradation de l'habitat et l'impact de la perte de saumon sur les systèmes biologiques et sociaux à travers l'étude de l'histoire et de l'économie politique. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 234.
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T BIOL 236 Agriculture Durable (5) NW
Explore la durabilité des avancées technologiques dans la production alimentaire mondiale. Les sujets comprennent les origines de l'agriculture, l'écologie et la conservation des sols, l'agriculture industrielle par rapport à l'agriculture biologique, la gestion intégrée des ravageurs, les organismes génétiquement modifiés (OGM) et les biocarburants. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 236.
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T BIOL 240 Biologie humaine et interactions environnementales (5/6) NW
Présente les systèmes biologiques humains en mettant l'accent sur les influences environnementales. Explore la structure et la fonction des principaux systèmes du corps (cardiovasculaire, endocrinien, pulmonaire, nerveux et excréteur) et les problèmes scientifiques et sociaux implicites dans la résolution des problèmes de santé humaine et d'environnement. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 240.
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T BIOL 242 Vieillissement et biologie (5) NW
Fournit aux étudiants une perspective biologique scientifique sur le vieillissement. Les étudiants acquièrent une compréhension des différentes théories du vieillissement, des changements normaux associés au vieillissement, des maladies liées à l'âge, avec une discussion pertinente sur les décisions politiques concernant notre population vieillissante croissante. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 242.
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T BIOL 252 La nature de la diversité humaine (5) NW, DIV
Fournit des perspectives de biologie génétique, évolutive et développementale sur la diversité humaine, en se concentrant sur des axes socialement pertinents (p. Examine des exemples historiques et actuels de la façon dont la discrétisation de la diversité biologique en catégories socialement construites crée des structures de pouvoir qui désavantagent les individus et les groupes de personnes.
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T BIOL 270 Génétique et société (5) NW
Couvre les avancées et les principes clés de la génétique et de la biologie moléculaire, fournissant un contexte pour évaluer de manière critique les sujets controversés de la biotechnologie auxquels la société contemporaine est confrontée. En considérant l'impact social de la technologie génétique et génomique, comprend les domaines de l'agriculture, de la médecine légale, de l'industrie, de la médecine et de la reproduction. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 370.
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T BIOL 301 Microbiologie générale (6) NW
Familiariser les étudiants avec les micro-organismes et leurs activités. Les sujets comprennent la structure et la fonction des cellules microbiennes, le métabolisme, la génétique microbienne et le rôle des micro-organismes dans la maladie, l'immunité et d'autres domaines appliqués. Passerelle vers les cours de la division supérieure en sciences biomédicales. Prérequis : une note minimale de 2.0 en T BIOL 140 et une note minimale de 2.0 en T CHEM 162.
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T BIOL 302 Physiologie Humaine (5) NW
Plonge les étudiants dans les concepts de base nécessaires à une compréhension fondamentale des systèmes physiologiques humains, y compris les systèmes gastro-intestinaux, endocriniens et immunitaires, en mettant l'accent sur les processus cellulaires qui interviennent dans les processus de l'organisme. Passerelle vers les cours de la division supérieure en sciences biomédicales. Prérequis : une note minimale de 2.0 en T BIOL 140 et une note minimale de 2.0 en T CHEM 162.
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T BIOL 303 Biologie Cellulaire (6) NW
Couvre les principes avancés des macromolécules biologiques, de la structure et de la fonction cellulaires, de la respiration et de certains domaines de la physiologie cellulaire en mettant l'accent sur les mécanismes de régulation, en se concentrant principalement sur les cellules eucaryotes. Prérequis : une note minimale de 2.0 en T BIOL 140 et une note minimale de 2.0 en T CHEM 162.
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T BIOL 304 Biologie moléculaire (6) NO
Se concentre sur les principes avancés de l'expression des gènes au niveau moléculaire, en mettant l'accent sur la transcription et la traduction. Fournit une expérience pratique dans l'application des techniques de biologie moléculaire à l'isolement et à la caractérisation des gènes de divers organismes dans le cadre de projets axés sur la recherche. Prérequis : une note minimale de 2,0 en T BIOL 140, une note minimale de 2,0 en T CHEM 162 et une note minimale de 2,0 en TMATH 116 ou TMATH 120.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 304

T BIOL 305 Génétique et génomique (6) NW
Couvre les principes de base de la génétique, y compris, mais sans s'y limiter : la génétique mendélienne, la structure des chromosomes, la génétique des populations, la biotechnologie, la bioinformatique et la cartographie et le séquençage du génome. Prérequis : une note minimale de 2,0 en T BIOL 140 une note minimale de 2,0 en T CHEM 162 et T BIOL 304, qui peuvent être pris simultanément recommandé: T BIOL 301 et T BIOL 303, qui peuvent être pris simultanément.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 305

T BIOL 306 Comportement Animal (5) NW
Explore les approches scientifiques du comportement animal, en mettant l'accent sur les mesures comportementales et les conceptions expérimentales. Couvre les principes psychologiques, physiologiques, développementaux et évolutifs qui guident l'étude de la perception animale, de la communication, de la recherche de nourriture et du comportement sexuel et social. Examine les applications à la conservation et au bien-être des animaux, et à la prise de décision humaine. Ne peut pas être crédité si crédit reçu en TESC 306. Prérequis : soit TPSYCH 101, PSYCH 101, T BIOL 110, TESC 110, T BIOL 120 ou TESC 120.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 306

T BIOL 307 Entomologie appliquée (6/7) NW
Explore la structure, l'écologie et l'évolution des arthropodes terrestres, en se concentrant principalement sur les insectes importants pour l'agriculture, la conservation, la médecine et la santé publique, et les approches durables de la lutte antiparasitaire. Prérequis : note minimale de 2.0 en T BIOL 120.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 307

T BIOL 312 Neurosciences sensorielles et des systèmes (5/6) NW, QSR
Examine la neuroanatomie, la neurophysiologie et la neurochimie des circuits du système nerveux central humain impliqués dans la sensation et le mouvement (p. Prérequis : soit une note minimale de 2,5 en T BIOL 140 ou une note minimale de 2,5 en TPSYCH 260.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 312

T BIOL 318 Biogéographie (5/6) NO
Étude de la distribution des plantes et des animaux, telle que contrôlée par le climat, l'histoire géologique et l'emplacement géographique, la dispersion, la colonisation et l'invasion. Examine les changements au fil du temps dans les modèles de distribution liés à l'évolution, au changement climatique et aux activités humaines. Intègre de nombreuses disciplines, notamment la biologie, l'écologie, l'anthropologie, l'histoire, les SIG, les statistiques et les sciences géologiques. Prérequis : soit TESC 120 ou TBIOL 120. Ne peut être crédité si crédit reçu en TESC 318.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 318

T BIOL 320 Anatomie et diversité des vertébrés (6) NW
Compare l'anatomie des membres du phylum des vertébrés dans un contexte évolutif. Explore la diversité des vertébrés et les modifications adaptatives uniques du plan corporel des vertébrés, en mettant l'accent sur les espèces du nord-ouest du Pacifique. Étudie par dissection, les structures anatomiques pendant les séances de laboratoire. Prérequis : T BIOL 140
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 320

T BIOL 340 L'écologie et ses applications (6) NW
Examine les processus et interactions clés (par exemple, la croissance et la régulation de la population, la compétition, la prédation, la symbiose et la structure des communautés biologiques) nécessaires pour comprendre l'écologie de base et ses applications. Les discussions sur la théorie écologique et les données d'une variété d'habitats sont complétées par une section de laboratoire requise pour inclure des visites sur le terrain, des simulations informatiques, des présentations d'étudiants et une analyse de la littérature primaire. Prérequis: note minimale de 2,0 en T BIOL 140 note minimale de 2,0 en T CHEM 162 note minimale de 2,0 en TMATH 110, TMATH 116, TMATH 120 ou STAT 220 et TESC 310 ou TBIOMD 310, qui peuvent être suivis simultanément.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 340

T BIOL 350 Introduction à l'épidémiologie (5) NW, QSR
Présente les concepts de base de l'épidémiologie et l'application et l'interprétation de méthodes quantitatives pour étudier les résultats de santé dans les populations humaines à travers des études de cas, des exemples contemporains et la littérature publiée. Prérequis : TMATH 110 ou STAT 220. Ne peut être crédité si crédit reçu pour TBIOMD 350.
Voir les détails du cours dans MyPlan : T BIOL 350

T BIOL 362 Introduction à l'écologie de la restauration (7) NW
Introduit la restauration écologique des écosystèmes endommagés. Couvre la base philosophique de la restauration ainsi que les forces sociales, biologiques et politiques qui ont un impact sur le succès de tout projet de restauration. Comprend des conférences, des lectures, des études de cas et des visites sur le terrain. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 362.
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T BIOL 401 Physiologie Microbienne (6) NW
Explore les réponses physiologiques des microbes aux stimuli environnementaux. Les sujets comprennent les caractéristiques structurelles, fonctionnelles et biochimiques des cellules microbiennes et leur régulation. Les laboratoires s'appuient sur des compétences fondamentales en microbiologie et en biologie moléculaire, préparant les étudiants à concevoir, réaliser et interpréter une expérience fondée sur des hypothèses. Prérequis : T BIOL 301 ou T BIOL 478 recommandé : T BIOL 304.
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T BIOL 404 Études de terrain néotropicales à l'étranger : écologie et communauté (12, max. 24) I&S/NW
Intègre les sciences naturelles, la culture et les aspects socio-économiques des régions néotropicales à une expérience pratique sur le terrain de la recherche en écologie tropicale. Au cours de quatre semaines d'études intensives sur le terrain à l'étranger dans les régions néotropiques ainsi que des sessions de pré- ou de suivi, les étudiants explorent la culture, la durabilité et la biodiversité et réalisent un projet de terrain indépendant négocié avec l'instructeur. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 404.
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T BIOL 414 Immunologie (5) NO
Examine la base moléculaire et cellulaire du système immunitaire des mammifères, y compris son rôle lors de l'infection par des micro-organismes (c'est-à-dire des bactéries, des virus et des parasites). De plus, ce cours aborde les principes de la vaccination et de l'éradication des maladies ainsi que des troubles du système immunitaire (c'est-à-dire l'auto-immunité, l'allergie et l'immunodéficience). Prérequis : une note minimale de 1,5 en T BIOL 301 et une note minimale de 1,5 en T BIOL 303.
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T BIOL 422 Évolution (5/6) NO
Implications de la déclaration de Dobzhansky selon laquelle « Rien en biologie n'a de sens sauf à la lumière de l'évolution ». Changement évolutif en évaluant les preuves qui font de l'évolution organique un thème unificateur dans le monde naturel. Problèmes évolutifs en médecine, agriculture, conservation de la biodiversité et affaires humaines. Offert avec un laboratoire (6 crédits) ou sans laboratoire (5 crédits). Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 422.
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T BIOL 432 Études de terrain sur l'écologie forestière (7/12)
Présente l'écologie forestière, en examinant les communautés forestières, les sols, les perturbations et la succession, les ravageurs forestiers et la durabilité, en mettant l'accent sur l'échantillonnage sur le terrain et l'analyse des données. L'option locale (7 crédits) comprend trois excursions obligatoires de 2 à 3 jours. L'option hors site (12 crédits) nécessite une étude de terrain intensive de deux semaines et des réunions sur le campus. Ne peut pas être crédité si crédit reçu pour TESC 432. Prérequis : TESC 310 soit TESC 340 ou T BIOL 340 et TMATH 110 ou STAT 220.
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T BIOL 434 La biologie de la conservation en pratique (6) NW
Explore les recherches actuelles sur les menaces à la biodiversité et les approches efficaces pour sa préservation. Analyser la littérature primaire et effectuer des exercices indépendants en laboratoire et sur le terrain. Prerequisite: TBIOL 340. Cannot be taken for credit if credit received for TESC 332.
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T BIOL 436 Systems Biology (5)
Provides students with the fundamental principles of systems biology including network circuitry of genes and proteins that can be used to predict emergent biological phenomena at the larger scale of cells and organisms for multiple applications. Prerequisite: either TESC 121 or T PHYS 121 either TESC 140 or T BIOL 140 either TESC 161 or T CHEM 162 either TESC 380 or T BIOL 304, either of which may be taken concurrently either TESC 405 or T CHEM 405, either of which may be taken concurrently. Cannot be taken for credit if credit received for TESC 436.
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T BIOL 438 Environmental Biology: Marine Invertebrates (6) NW
Examines the structure, function, life histories, ecology, and evolution of major groups of marine invertebrate animals. Lectures, discussions, images, and library research augmented by laboratory work with live organisms whenever possible. Integrates details of biodiversity with issues and concepts from ecology and environmental science. Prerequisite: minimum grade of 2.0 in T BIOL 120.
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T BIOL 442 Marine Ecology (7) NW
Explores the natural history and interactions among marine organisms, emphasizing Pacific Northwest intertidal invertebrates. Includes all-day and weekend-long field trips to sites around Puget Sound. Includes topics such as biology of coral reefs, kelp forests, estuaries, marine fisheries, and marine conservation. Prerequisite: T BIOL 340.
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T BIOL 452 Plants, Insects, and their Interactions (7) NW
Emphasizes hands-on exploration of the natural history and ecology of plants and insects and interactions amongst them. Includes a series of all-day field trips focusing on biological issues relevant to resource management and agricultural production in different sites around Puget Sound. Prerequisite: minimum grade of 2.0 in T BIOL 140.
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T BIOL 456 Urban Animal Ecology (7) NW
Provides hands-on experience with wildlife ecology and management techniques in both urban and non-urban settings throughout the Seattle-Tacoma megapolitan region. Topics includes animal handling and safety, camera-trap field work, GIS and R analytical skills, data management, effective community engagement, and coupled human and natural systems (CHANS) theory. Prerequisite: T BIOL 140 recommended: T BIOL 340 and TMATH 110.
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T BIOL 462 Restoration Ecology Capstone: Introduction (2-) NW
First of a three-course capstone sequence in restoration ecology. Students review and assess project plans and installations. Class meets with members of previous capstone classes to review their projects. Offered: jointly with BES 462/ESRM 462.
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T BIOL 463 Restoration Ecology Capstone: Proposal and Plan (-3-) NW
Student teams prepare proposals in response to requests for proposals (RFPs) from actual clients. Clients may be governments, non-profit organizations, and others. Upon acceptance of the proposal, teams prepare restoration plans. Prerequisite: ESRM 462. Offered: jointly with BES 463/ESRM 463.
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T BIOL 464 Restoration Ecology Capstone: Field Site Restoration (-5) NW
Teams take a restoration plan developed in ESRM 463 and complete the installation. Team participation may include supervision of volunteers. Teams prepare management guidelines for the client and conduct a training class for their use. Prerequisite: ESRM 463. Offered: jointly with BES 464/ESRM 464.
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T BIOL 478 Environmental Microbiology (6) NW
Explore microbial diversity and the applied effects of microorganisms on the environment and human welfare. Topics include metabolic diversity, ecological interactions, biogeochemistry, microbial habitats, and waste treatment and bioremediation. Prerequisite: either TESC 340 or T BIOL 340. Cannot be taken for credit if credit received for TESC 378.
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Pyrodiversity begets plant–pollinator community diversity

Fire has a major impact on the structure and function of many ecosystems globally. Pyrodiversity, the diversity of fires within a region (where diversity is based on fire characteristics such as extent, severity, and frequency), has been hypothesized to promote biodiversity, but changing climate and land management practices have eroded pyrodiversity. To assess whether changes in pyrodiversity will have impacts on ecological communities, we must first understand the mechanisms that might enable pyrodiversity to sustain biodiversity, and how such changes might interact with other disturbances such as drought. Focusing on plant–pollinator communities in mixed-conifer forest with frequent fire in Yosemite National Park, California, we examine how pyrodiversity, combined with drought intensity, influences those communities. We find that pyrodiversity is positively related to the richness of the pollinators, flowering plants, and plant–pollinator interactions. On average, a 5% increase in pyrodiversity led to the gain of approximately one pollinator and one flowering plant species and nearly two interactions. We also find that a diversity of fire characteristics contributes to the spatial heterogeneity (??-diversity) of plant and pollinator communities. Lastly, we find evidence that fire diversity buffers pollinator communities against the effects of drought-induced floral resource scarcity. Fire diversity is thus important for the maintenance of flowering plant and pollinator diversity and predicted shifts in fire regimes to include less pyrodiversity compounded with increasing drought occurrence will negatively influence the richness of these communities in this and other forested ecosystems. In addition, lower heterogeneity of fire severity may act to reduce spatial turnover of plant–pollinator communities. The heterogeneity of community composition is a primary determinant of the total species diversity present in a landscape, and thus, lower pyrodiversity may negatively affect the richness of plant–pollinator communities across large spatial scales.

Annexe S1. Pyrodiversity and environmental heterogeneity weighted metrics.

Annexe S2. Dissimilarity standardization.

Tableau S1. The support for including pyrodiversity weighted by fire history similarity and its interaction with fire severity and drought intensity.

Tableau S2. The support for including heat load diversity and interaction with fire severity and drought intensity.

Tableau S3. The support for including topographic compound index diversity and interaction with fire severity and drought intensity.

Graphique S1. The distribution of heat load estimates, topographic compound index estimates in the Illilouette Basin.

Graphique S2. The response of floral, bee and interaction richness to pyrodiversity weighted by the similarity of fire history.

Graphique S3. The response bee, floral and interaction richness to heat load diversity.

Graphique S4. The effect of fire severity on the abundance of floral resources throughout the study season.

Graphique S5. The specialization of pollinator communities across the study landscape in severe (2013) and extreme (2014) drought years.

Graphique S6. The response of richness of species within the 32 genera collected to pyrodiversity.

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